随着未央协议的重启和源源不断的新星系开拓需求，各组织迫切需要一种大规模调动内部力量，便利集体行动的工具，组织计划应运而生。所有家族、公会、同盟在组织达到一定等级后可获得组织计划的名额，组织计划的范围将大于目前个体的常规计划。
组织计划由组织领袖/副领袖建立，并指定一名组织成员为该组织计划的指挥官。组织计划建立后，所有组织成员可通过新增指令“使用”组织计划，消耗1个计划名额获得组织计划的使用权。“使用”组织计划后，成员将可以在组织计划范围内下达特定的指令。
组织计划拥有一定数量的指挥名额，组织成员可通过“委派”指令消耗1个指挥名额，将舰队调动至组织计划内，委托给对应的指挥官进行指挥。
组织计划拥有策略值上限，使用“委派”指令时可以为组织计划补充策略值，并将该舰队的指挥权暂时移交至指挥官。指挥官可消耗组织计划的策略值，在组织计划范围内指挥委派舰队执行“调动”、“驻守”及“行动”指令。
家族、公会将作为新组织加入到拉格朗日银河中，同盟也将迎来调整获得新能力。
家族，联系紧密，拥有“家族仓库”功能，创立时人数上限为10，可通过组织天赋将人数上限拓展为30。
公会，重视军务，拥有“公会船坞”功能，创立时人数上限为20，可通过组织天赋将人数上限拓展为50。
同盟，规模庞大，拥有更强的指挥能力，创立时人数上限为30，可通过组织天赋将人数上限拓展为100。
家族可以任命一名成员为“后勤总长”，后勤总长可在己方太空站空域内的对接点上接驳建造“家族仓库”，建造完成后家族成员可通过指令“运输”将金属、晶体、重氢资源运输至家族仓库中。后勤总长可以将家族仓库中的资源分配到与太空站联络的家族成员舰队中，实现家族成员之间资源的交换。
家族仓库的吞吐量和建造数量将受到限制，可以通过解锁组织天赋进行提升。
公会可以任命一名成员为“港务官”，港务官可在己方太空站空域内的对接点上接驳建造“公会船坞”，建造完成后公会成员可通过指令“转隶”将舰队调动并移交至公会船坞。港务官可以将公会船坞中的舰船，分配到与太空站联络的公会成员舰队中，实现公会成员之间舰船的交换。
公会船坞的规模和建造数量将受到限制，可以通过解锁组织天赋进行提升。
同盟相较于家族与公会，可以通过解锁组织天赋获得更高的人数上限与更多的组织计划数量。
家族、公会、同盟的组织等级提升后，将获得一定数量的天赋点。组织领袖可以将这些天赋点用于解锁组织天赋，使组织获得人数上限增加、空间站防御能力增强、组织成员资源获取能力增强、家族仓库/公会船坞/组织计划强化等效果。已解锁的组织天赋在满足条件后，可进行重置并返还对应天赋点。
所有的组织都可以根据自身的情况，将天赋点分配至不同的领域，以打造有特点、有个性的多元组织架构。
玩法更新后，同盟将不再随组织等级提升而自动增加人数上限，所有组织都将通过解锁组织天赋的方式增加人数上限。同时，已有同盟将根据组织等级获得对应数量的天赋点，并默认解锁所有可解锁的人数上限增加类天赋。